Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn20O55082 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms