Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole2O54956 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole2O54956 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole2O54956 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole2O54956 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole2O54956 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms