Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33bO35963 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33bO35963 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33bO35963 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33bO35963 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33bO35963 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33bO35963 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33bO35963 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33bO35963 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33bO35963 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33bO35963 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab33bO35963 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33bO35963 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33bO35963 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33bO35963 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33bO35963 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab33bO35963 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33bO35963 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab33bO35963 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33bO35963 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33bO35963 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33bO35963 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33bO35963 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33bO35963 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33bO35963 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33bO35963 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab33bO35963 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab33bO35963 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab33bO35963 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab33bO35963 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab33bO35963 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab33bO35963 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab33bO35963 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33bO35963 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33bO35963 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33bO35963 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33bO35963 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33bO35963 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33bO35963 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33bO35963 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33bO35963 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33bO35963 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33bO35963 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33bO35963 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab33bO35963 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33bO35963 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33bO35963 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33bO35963 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33bO35963 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33bO35963 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33bO35963 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33bO35963 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33bO35963 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33bO35963 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33bO35963 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33bO35963 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab33bO35963 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab33bO35963 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33bO35963 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33bO35963 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33bO35963 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33bO35963 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab33bO35963 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab33bO35963 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab33bO35963 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab33bO35963 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab33bO35963 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab33bO35963 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab33bO35963 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rab33bO35963 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab33bO35963 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab33bO35963 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab33bO35963 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab33bO35963 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab33bO35963 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab33bO35963 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab33bO35963 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab33bO35963 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab33bO35963 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab33bO35963 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab33bO35963 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab33bO35963 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab33bO35963 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms