Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn6O35646 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn6O35646 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn6O35646 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn6O35646 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn6O35646 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn6O35646 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms