Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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