Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Ptpn9O35239 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Ptpn9O35239 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Ptpn9O35239 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Ptpn9O35239 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Ptpn9O35239 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ptpn9O35239 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn9O35239 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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