Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms