Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms