Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim55G3X8Y1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms