Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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