Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms