Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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