Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms