Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms