Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms