Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt2E9PUL5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms