Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm5478D3Z6R0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm5478D3Z6R0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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