Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1330D3Z460 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms