Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms