Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms