Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms