Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms