Protein–RNA interactions for Protein: A2AUQ8

4930402F06Rik, MCG21268, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402F06RikA2AUQ8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402F06RikA2AUQ8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms