Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Prdm12A2AJ77 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm12A2AJ77 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms