Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms