Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B694

Trav14-2, T cell receptor alpha variable 14-2 (Fragment), mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14-2A0A075B694 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trav14-2A0A075B694 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav14-2A0A075B694 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav14-2A0A075B694 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav14-2A0A075B694 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav14-2A0A075B694 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav14-2A0A075B694 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav14-2A0A075B694 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav14-2A0A075B694 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav14-2A0A075B694 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav14-2A0A075B694 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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