Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Olfr161-202ENSMUST00000216259 7133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Slc7a14-201ENSMUST00000091259 8897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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