Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms