Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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