Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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