Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 A330076C08Rik-202ENSMUST00000223513 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Grip1-213ENSMUST00000147454 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Ctnna3-203ENSMUST00000105441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg7os-202ENSMUST00000131841 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Slc39a9-201ENSMUST00000085245 5201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Kcna4-201ENSMUST00000037012 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Mro-201ENSMUST00000119239 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Kbtbd4-201ENSMUST00000090682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 Serpina3k-201ENSMUST00000043058 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Slc30a6-202ENSMUST00000179074 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Abi2-210ENSMUST00000189980 4115 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Phactr4-203ENSMUST00000102568 4614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Pacsin2-202ENSMUST00000165095 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm33533-201ENSMUST00000193853 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 C6-201ENSMUST00000022788 2447 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 2610008E11Rik-201ENSMUST00000039271 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 Helb-201ENSMUST00000020449 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Slc34a1-205ENSMUST00000225259 3983 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpk-224ENSMUST00000224182 2754 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 AC120163.1-201ENSMUST00000228618 1680 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms