Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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