Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms