Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Asns-201ENSMUST00000031766 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Sec23ip-201ENSMUST00000042942 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Fut10-203ENSMUST00000161502 3527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 CT025642.3-201ENSMUST00000225503 4086 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Sltm-201ENSMUST00000049263 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 6820431F20Rik-202ENSMUST00000153748 4659 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm42515-201ENSMUST00000199936 3583 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Trim17-202ENSMUST00000075141 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Flrt3-201ENSMUST00000056760 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
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Lrrc43Q3V0L5 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Ctage5-220ENSMUST00000177225 2872 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Arpp21-230ENSMUST00000172380 3366 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Olfr531-202ENSMUST00000216053 2330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
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Lrrc43Q3V0L5 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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Lrrc43Q3V0L5 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
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Lrrc43Q3V0L5 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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Lrrc43Q3V0L5 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
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Lrrc43Q3V0L5 Prps1l1-201ENSMUST00000134550 1676 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Lrrc43Q3V0L5 Orc1-201ENSMUST00000102744 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Tifab-201ENSMUST00000169652 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Lrrc43Q3V0L5 Vipas39-201ENSMUST00000021426 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Cep41-201ENSMUST00000031810 3447 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Lrrc43Q3V0L5 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc1-201ENSMUST00000113421 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
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Lrrc43Q3V0L5 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm13466-201ENSMUST00000121515 999 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 L3mbtl2-204ENSMUST00000172748 3368 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lrrc43Q3V0L5 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms