Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Ccl20O89093 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Ccl20O89093 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Ccl20O89093 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Ccl20O89093 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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