Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms