Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr943-205ENSMUST00000215770 8308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 Tmem52b-201ENSMUST00000032263 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
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