Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Ccdc18Q640L5 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Ccdc18Q640L5 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Ccdc18Q640L5 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Ccdc18Q640L5 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Hecw1-201ENSMUST00000110516 9460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Ccdc18Q640L5 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
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Ccdc18Q640L5 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Ccdc18Q640L5 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Pclo-202ENSMUST00000182407 16846 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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