Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms