Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pfdn5Q9WU28 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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