Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb3Q9R1P1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms