Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms