Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms