Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms