Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms