Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg1Q9QZE5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg1Q9QZE5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg1Q9QZE5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg1Q9QZE5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg1Q9QZE5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Copg1Q9QZE5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Copg1Q9QZE5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms