Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms