Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms