Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms