Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nova1Q9JKN6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms